Le centre Gustave Roussy fait appel à Lifen pour faciliter la recherche en oncologie

La start-up e-santé Lifen a signé un contrat cadre avec le centre régional Gustave Roussy, premier établissement de lutte contre le cancer en Europe. Il utilisera ses solutions d’intelligence artificielle pour transformer automatiquement et en temps réel les informations des patients de l’établissement en bases de données anonymisées destinées à la recherche en oncologie.

Lauréate du plan France 2030, Lifen a choisi d’annoncer cette collaboration en présence du président Emmanuel Macron lors de l’événement qui célèbre les deux ans du programme. Il se déroule ce 11 décembre 2023 à Toulouse.

Créer des bases de données pour la recherche

Lifen est une start-up parisienne qui propose depuis 2015 des solutions logicielles à base d'intelligence artificielle pour le secteur médical. Elle équipe aujourd’hui 800 hôpitaux en France et a diversifié ses activités autour de la gestion des données de santé. Elle était déjà l’entreprise de routage des courriers de Gustave Roussy depuis 2021.

Dans le cadre de ce nouveau contrat avec l’institut de recherche, elle déploie un algorithme qui lit les comptes rendus médicaux produits dans le cadre des soins courants (biologie, résultat de scanner, consultations) et en extrait les données utiles pour créer des bases de données destinées à la recherche.

De nombreux projets sont planifiés entre les deux acteurs, mais le premier vise à constituer une base de données de premier plan sur le cancer du poumon en France. Il devrait inclure 5000 patients fin 2024 et prévoit d'en analyser le parcours de soins sur plus de 150 critères.

L’IA pour éviter de standardiser les comptes rendus médicaux

Gustave Roussy a besoin de récupérer la masse critique de données produites dans son établissement et de bien l’ordonner pour optimiser ses projets de recherche.

Pour ce faire, l’institut utilisait historiquement un CRF pour remplir les données en anonymisant les patients. "Depuis des années, les solutions proposées pour le remplissage automatique des données de santé demandent aux docteurs de structurer les informations dans le dossier, avec des chams pré remplis. Mais ça donne des comptes rendus complètement illisibles et déshumanisés, et puis nous ne sommes pas des machines…", raconte le Pr Benjamin Besse, Directeur de la Recherche Clinique chez Gustave Roussy.

Un travail chronophage

Ensuite, des techniciens de recherche clinique ou attachés de recherche clinique intégraient ces informations dans des bases de données à partir du dossier des patients. Un travail long et chronophage : "Rentrer 8,2 dans le champ "hémoglobine" sur un logiciel, ce n’est pas la partie la plus incroyable du métier", illustre le professeur.

C’est là qu’intervient la technologie de Lifen, qui automatise cette tâche. Comme elle est capable de traiter des comptes rendus de toutes formes, il n’y a pas besoin de les standardiser. Les 300 médecins de Gustave Roussy peuvent donc à nouveau les écrire comme ils l’entendent, et les adapter à la personne à qui ils sont destinés : médecin ou patient.

Un délai de structuration divisé par 7

Le centre de recherche dit par ailleurs faire des économies, et gagner en rapidité d'exécution et en qualité de donnée. Avant de signer cet accord-cadre, une étude collaborative a été réalisée pour comparer la cohérence des informations patients entre la saisie manuelle et la saisie automatique sur une base de 7 200 points de données. L’utilisation de la solution aurait démontré une exactitude supérieure à la saisie manuelle et un délai de structuration divisé par 7.

"Et surtout, on n’a pas besoin, comme pour les solutions classiques, de mettre un tracker dans notre système informatique qui aspire nos données", souligne le professeur Besse "En fait on n'a eu aucune manipulation informatique à faire".

Le contrat s’inscrit sur une durée indéterminée. Les deux hommes n’ont pas souhaité en dévoiler davantage sur ses modalités financières mais ont assuré que c’était une collaboration gagnant-gagnant. C’est Gustave Roussy Transfert, la filiale du centre de recherche qui assure la valorisation des actifs générés par sa communauté scientifique et médicale, qui s’est occupé du contrat avec Lifen.